Colecţia prezintă ţesături decorative importate din Italia; broderii; manuscrise miniate ferecate în metal preţios; sculpturi în lemn; pietre de mormânt dăltuite în piatră, aflate în biserică. În mănăstire există o valoroasă bibliotecă. În 2003 - 2004 au fost restituite importante obiecte de cult, confiscate între anii 1971 - 1973, pentru a putea fi expuse în muzeu cu ocazia manifestărilor prilejuite de comemorarea a 500 de ani de la moartea domnitorului Ştefan cel Mare. Au fost recuperate 25 de broderii, cărţi de cult şi alte obiecte foarte valoroase. De asemenea, au fost... restituite şi opt icoane reprezentându-i pe opt dintre apostoli. Printre cele mai valoroase obiecte se numără Tetraevangheliarul de la Humor (1473), o cruce cu trei braţe (datată 1503, cea mai veche de pe teritoriul României), sculptată în lemn şi o cădelniţă, confecţionată din argint aurit, dăruită mitropolitului Teoctist în semn de mulţumire după ce înaltul ierarh l-a uns domn pe Ştefan cel Mare. Un alt obiect foarte valoros este o broderie din mătase cu Înălţarea Domnului sau acoperământul de mormânt al doamnei Maria de Mangop.
