Colecția a fost fondată la începutul anilor 1970 de către profesorul universitar Ferenc Pozsony. Din 1974 a fost depozitată într-o casă țărănească, construită la începutul secolului 20. În deceniul următor colecția s-a dezvoltat și cu obiecte din diferite zone etnografice ale Ardealului și Moldovei. În prezent deține colecții de valoare cuprinzând mobilier, ceramică, textile, port popular și unelte legate de ceangăi, secui, români, sași și romi. În anul 1993 a fost organizată prima expoziție intitulată: Arta tradițională din Zăbala, iar în 2003 a fost deschisă prima expoziție permanentă, Cultura tradițională a ceangăilor din Moldova. După aceea colecția treptat a fost inventariată, descrisă și digitaliza...tă de către studenții de la secția de etnologie a Universității Babeș-Bolyai din Cluj-Napoca. În anul 2004 a fost constituită Asociația Pro Museum Zăbala, astăzi proprietarul colecțiilor și imobilelor. Din anul 2005 muzeul a devenit o secție externă a Muzeului Național Secuiesc din Sfântu Gheorghe, județul Covasna. Din anul 2007 a fost demarată integrarea colecției în circuitul național muzeal din România și acreditarea ei. Instituția este susținută de Consiliul Local al Comunei Zăbala, de Consiliul Județean Covasna, cât și de diferite fundații culturale.