Muzeul deține colecții de arheologie din nordul Dobrogei: pre și protoistorie, greco-elenistică, daco-romană, medievală (ceramică, sticlă, unelte, arme, podoabe), numismatică: antică, medievală, modernă (tezaure monetare cu piese romane, genoveze, tătărești), lapidariu (monumente epigrafice și sculpturale).